Исследователи Крымского федерального университета занимаются разработкой нового поколения вакцины от COVID-19. Ученые пытаются подобрать и синтезировать
антисмысловой олигонуклеотид, который способен блокировать активные участки вируса.

Статья, где описывается оригинальная идея по разработке вакцины от коронавируса с использованием технологии тиосульфатных олигонуклеотидов, опубликована в журнале
Inflammation Research (DOI: 10.1007/s00011-020-01377-3).

Учёные отмечают, что если следовать наиболее вероятному сценарию, который аналогичен сценарию, используемому для создания сезонных вакцин против гриппа, то
потребуется ежегодно разрабатывать улучшенные формулы вакцин для контроля распространения нового, легко изменяющегося коронавируса. В статье, используя в
качестве примеров известные РНК-вирусы (ВИЧ, вирусы гриппа и другие), рассмотрены основные успехи и неудачи в создании в первую очередь высокоэффективных вакцин.

«Наиболее эффективными вакцинами против коронавируса будут те, которые способны приводить к образованию высокоэффективных клеток памяти как для гуморального, так и для клеточного иммунитета. К сожалению, РНК-вирусы очень изменчивы и в этой ситуации одним из наиболее многообещающих решений в борьбе с пандемией COVID-19 может стать создание «универсальных» вакцин на основе консервативных последовательностей генома SARS-CoV-2 (антиген-презентирующих) и
неметилированных CpG-динуклеотидов (адъювантов) в составе фосфоротиоатного остова одноцепочечных олигонуклеотидов ДНК. Мы предлагаем в качестве модели создание вакцины на основе лассо-подобной фосфоротиоатной олигонуклеотидной конструкции, содержащей фрагменты, подобные CpG, и антиген-презентирующую уникальную ACG- последовательность генома SARS-CoV-2», — комментирует ведущий исследователь в области изучения тиофосфатных олигонуклеотидов, доцент Крымского федерального университета Владимир Оберемок.

Учёные обнаружили, что CpG-динуклеотиды являются наименее редкими динуклеотидами в геномах SARS-CoV-2 и других известных коронавирусов человека, и
предположили, что их более частая встречаемость может быть причиной более тяжелого течения заболевания за счет стимуляции развития «цитокиновой бури». Интересно, что штаммы вируса, секвенированные в Китае (Ухань) в феврале 2020 года, содержали в среднем на 1 динуклеотид CpG больше в своем геноме, чем более поздние штаммы из
США (Нью-Йорк), секвенированные в мае 2020 года. Исследователи отмечают, что на первых этапах микроэволюции коронавируса в человеческой популяции, естественный отбор имеет тенденцию отбирать вирусные геномы, содержащие меньше CpG фрагментов, которые не вызывают сильный врожденный иммунный ответ, поэтому у инфицированного человека наблюдаются умеренные симптомы и он с большей готовностью распространяет вирус. «Однако, по нашему мнению, неметилированные динуклеотиды CpG также способны подготовить иммунную систему хозяина к коронавирусной инфекции и должны присутствовать в вакцинах SARS-CoV-2 в качестве сильных адъювантов», — отметил курирующий исследования проректор по научной деятельности Анатолий Кубышкин.